Ozon uygulanmasının yasak olduğu hastalıklar son derece sınırlıdır.

• Alyuvarlarda bir enzim eksikliği ile seyreden, Bakla Alerjisi olarak bilinen favizm (Gl-6-F dehidrogenaz enzim eksikliği) olarak adlandırılan hastalıklarda

• Aşırı alkol kullanımında

• Hipertiroidi

• İleri derecede kansızlık ve kanla ilgili bazı rahatsızlıklarda (Hemofili, kanama-pıhtılaşma hastalıkları)

• Yeni gelişmiş kalp enfarktüsü ve kanamanın aktif olarak devam ettiği durumlarda

• Ozona karşı alerjisi veya intoleransı (tahammülsüzlüğü) olanlarda (çok nadir görülen bir durum olup daha ziyade kokuya olan tahammülsüzlüklerde oluşur.)